略歴 富山大学 研究者プロファイル
出身大学・大学院
2013年3月 東京大学薬学部薬科学科 卒業
2015年3月 東京大学大学院薬学系研究科修士課程 修了
2018年3月 東京大学大学院薬学系研究科博士課程 修了
職務経歴
2018年4月 東京大学大学院薬学系研究科 博士研究員
2018年12月 英国・オックスフォード大学化学部 博士研究員
2021年1月 富山大学和漢医薬学総合研究所 助教
研究テーマ
部門
分野
領域
プロジェクト
研究の概要
市販されている薬剤の6割は天然物または天然物に由来する化合物であり、天然物創薬は私たち人類に多大な恩恵をもたらしています。これら天然物がどのようにして生物によって創られ、どのようにして薬剤として働くのかを知ることは、天然物の多様性を追究し、創薬に結びつけることに必須と言えます。X線結晶構造解析は、ユニークな構造をもつ天然物の生成に関わる酵素の構造や、天然物が創薬のターゲットとなるヒトタンパク質に作用している様子を実験的に確かめる手法の一つです。この技術を利用することで、酵素の機能を明らかにすると共に天然物がもつ創薬の可能性をより発展させていきます。
研究への想い
複雑で奇妙な形をした天然物がどう組み上がっていくのか。その製造工程を一つひとつ解き明かしていくことが天然物化学の楽しみの一つです。そして、創薬として利用される天然物がどのようにヒトのタンパク質に作用するのかを解き明かしたい。巨大な天然物でも小さな天然物でもその面白みは相当なものです。
論文
Nakashima, Y., Brewitz, L., Tumber, A., Salah, E., Schofield, C. J. “2-Oxoglutarate derivatives can selectively enhance or inhibit the activity of human oxygenases”
Nature Commun., 12, Article number: 6478 (2021).
Brewitz, L., Nakashima, Y., Schofield, C. J. “Synthesis of 2-oxoglutarate derivatives and their evaluation as cosubstrates and inhibitors of human aspartate/asparagine-β-hydroxylase”
Chem. Sci., 12, 1327-1342 (2021).
Nakashima, Y., Mitsuhashi, T., Matsuda, Y., Senda, M., Sato, H., Yamazaki, M., Uchiyama, M., Senda, T., Abe, I. “Structural and computational bases for dramatic skeletal rearrangement in anditomin biosynthesis”
J. Am. Chem. Soc., 140, 9743-9750 (2018).
Nakashima, Y., Mori, T., Nakamura, H., Awakawa, T., Hoshino, S., Senda, M., Senda, T., Abe, I. “Structure function and engineering of multifunctional non-heme iron dependent oxygenases in fungal meroterpenoid biosynthesis”
Nature Commun., 9, Article number: 104 (2018).
Wakimoto, T., Egami, Y., Nakashima, Y., Wakimoto, Y., Mori, T., Awakawa, T., Ito, T., Kenmoku, H., Asakawa, Y., Piel, J., Abe, I., “Calyculin biogenesis from a pyrophosphate protoxin produced by a sponge symbiont”
Nature Chem. Biol., 10, 648-655 (2014).
キーワード
天然物、生合成、構造解析、酵素工学
